- Oggetto:
- Oggetto:
Biomatematica (DM 270) - a.a. 2014/15
- Oggetto:
Biomathematics
- Oggetto:
Anno accademico 2014/2015
- Codice dell'attività didattica
- MFN0430
- Docente
- Prof. Ezio Venturino (Titolare del corso)
- Corso di studi
- Laurea Magistrale in Matematica (D.M. 270)
- Anno
- 1° anno 2° anno
- Periodo didattico
- Secondo semestre
- Tipologia
- D.M. 270 TAF C - Affine o integrativo
- Crediti/Valenza
- 6
- SSD dell'attività didattica
- MAT/08 - analisi numerica
- Modalità di erogazione
- Tradizionale
- Lingua di insegnamento
- Inglese
- Modalità di frequenza
- Facoltativa
- Tipologia d'esame
- Orale
- Prerequisiti
-
Fondamenti sulle equazioni differenziali ordinarie; Analisi I, II, III, IV.
Fondamenti sui sistemi dinamici.
Fondamenti di algebra lineare.
Elementi fondamentali di un
linguaggio evoluto quale Matlab oppure Maple, e di un linguaggio di
programmazione quale Fortran oppure C.
Se qualcuno di questi
prerequisiti mancasse, si ovviera' al problema durante il
corso stesso.
Analisi del piano delle fasi, determinazione di equilibri,
progettazione ed esecuzione di programmi
Matlab e Maple per la simulazione dei modelli presentati a lezioneFundamental notions in ordinary differential equations, dynamical systems, linear algebra.
Basic knowledge of a programming language such Matlab, Maple, C, Fortran.
In case these prerequisites are missing,
they will be reviewed at the beginning of the course.
Phase plane analysis, equilibria and their stability assessment, experience in simulations
will be the main tools acquired in the course. - Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Il corso si propone di affrontare lo studio dei principali modelli matematici in biologia matematica. Gli strumenti matematici si sono considerati allo scopo sono costituiti dalle equazioni differenziali ordinarie e alle derivate parziali, dalle equazioni integrali e dalle equazioni integro-differenziali.
INDICATORI DI DUBLINO (in riferimento al Regolamento Didattico di Ateneo, descrittori europei del titolo di studio- "descrittori di Dublino", http://www.study-in-italy.it/php4/scheda_corso.php?ambiente=googol&anno=2009&corso=1214981):
Conoscenza e comprensione IIl corso rivisita argomenti di base, permettendo di rafforzare le conoscenze di base (obiettivo 1) ma sviluppa anche nuovi concetti (obiettivo 3). L'utilizzo di articoli della letteratura corrente in materia si propone di migliorare le capacità di lettura dello studente, anche in lingua (obiettivo 2). Il corso costituisce un primo passo per la costruzione di modelli avanzati per le applicazioni in biologia (obiettivo 5) e quindi per l'avviamento alla ricerca (obiettivo 9). I progetti e l'attivita' di laboratorio servono per stimolare le capacità di risoluzione di problemi (obiettivo 6). All'inizio del corso sono menzionati alcuni cenni storici sullo sviluppo della disciplina (obiettivo 8). I modelli discreti presentati nel corso potranno essere adattati a una presentazione a livello di scuola superiore (obiettivo 7).
Capacità di applicare conoscenza e comprensione L'attivita' di laboratorio prevista nel corso, permette agli studenti di affrontare problemi nuovi e di risolverli sfruttando i concetti teorici (obiettivi 1,2,3,5). I progetti finali presentano tematiche di avviamento alla ricerca nell'ambito della biomatematica (obiettivi 4 e 9)
Autonomia di giudizio (making judgements) Allo studente e' richiesta una maturazione, deve saper riconoscere errori di formulazione di modelli e correggerli (obiettivi 1,2). La discussione con il docente e gli altri studenti facilitera' questo compito, e costituisce il motivo per cui i progetti finali vengono redatti in piccoli gruppi (obiettivo 6). E' richiesta inoltre la consultazione di letteratura in tematiche relative al corso, passo necessario per l'avviamento alla ricerca e la capacita' di affrontare nuove situazioni (obiettivo 7)
Abilità comunicative La letteratura da consultare sara' in lingua Inglese, la lingua oggi normalmente usata in ambito scientifico, abituando lo studente al suo uso in ambito scientifico (obiettivo 1). La presentazione dei progetti avviene attraverso un seminario orale, obbligando lo studente ad usare un linguaggio scientificamente appropriato (obiettivo 2), nonche' a coloro che sentono la presentazione di interagire in quanto sono obbligati a fare delle domande (obiettivo 4)
Capacità di apprendimento Con la formulazione di modelli in ambito biologico, gli studenti affinano la loro capacita' critica, e si preparano eventualmente anche per gli studi del terzo livello o per l'inserimento in ambito lavorativo (obiettivi 1 e 2)Some familiarity with dynamical systems is assumed. To provide some basic information
on temporal evolution of
populations, structured populations, chemostat and
chemical reactions kinetics, reaction-diffusion mechanisms,
biological
waves, pattern formation and epidemiological models are the main goals of the course.- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Gli studenti al termine del corso dovranno aver familiarita' coni modelli fondamentali della materia, retti
da equazioni differenziali ordinarie e alle derivate parziali.
Lo studente dovra' anche aver acquisito nozioni sul
contesto biologico in cui si studiano questi modelli,
principalmente dato dai seguenti argomenti. L'evoluzione temporale
di popolazioni
singole e interagenti, le popolazioni strutturate, il chemostato e la
cinetica delle reazioni chimiche, i
meccanismi di reazione e diffusione,
le onde biologiche, i fenomeni di formazione di pattern, la teoria di
trasmissione
neurale, i modelli epidemiologici.Some familiarity with dynamical systems is assumed. To provide some basic information
on temporal evolution of
populations, structured populations, chemostat and
chemical reactions kinetics, reaction-diffusion mechanisms,
biological
waves, pattern formation and epidemiological models are the main goals of the course.- Oggetto:
Modalità di verifica dell'apprendimento
In generale l'esame e' costituito dalla presentazione e discussione in sala informatizzata di un progetto redatto durante il semestre da squadre di 2 o 3 studenti. La presentazione di questi elaborati viene fatta nelle prime settimane successive alla fine del corso. Il docente potra' anche alternativamente decidere di sostituire il progetto con un esame scritto con domande di teoria e di esercizi, a ciascuna delle quali verra' dato un punteggio.Presentation of the project elaborated in the second part of the course by each team of students. The teacher could also decide to have a written test containing also theoretical questions.- Oggetto:
Programma
Il contesto biologico in cui si studieranno questi modelli e' principalmente dato da: l'evoluzione temporale di popolazioni singole e interagenti, le popolazioni strutturate, il chemostato e la cinetica delle reazioni chimiche, i meccanismi di reazione e diffusione, le onde biologiche, i fenomeni di formazione di pattern, la teoria di trasmissione neurale, i modelli epidemiologici.
Temporal evolution of one single population. Inteacting populations. Structured populations. Chemostat and chemical reactions kinetics. Reaction diffusion equations, biological waves, pattern formation, neural transmission, epidemiology.
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
- - E. Venturino, note in preparazione. -F. Brauer, C. Castillo-Chavez, Mathematical Models in Population Biology
and Epidemiology, Springer.
J.D. Murray, Mathematical Biology, Springer.
J. Cronin, Mathematical Aspects of Hodgkin-Huxley neural theory,
Cambridge Univ. Press.
B. Charlesworth, Evolution in age-structured populations,
Cambridge Univ. Press.
H. Smith, P. Waltman, The theory of the Chemostat,
Cambridge Univ. Press.
E. Renshaw, Modelling Biological Populations in Space and Time,
Cambridge Univ. Press.
V. Comincioli, Problemi e Modelli Matematici nelle Scienze Applicate,
Ambrosiana.
A. Okubo, S. Levin, Diffusion and Ecological Problems: Modern
Perspectives, Springer, 2001.
Stanley J. Farlow, Partial Differential Equations for Scientists and
Engineers, Dover.
David L. Powers, Boundary value problems, Academic Press.
Jeffery M. Cooper, Introduction to Partial Differential Equations
with Matlab, Birkhaeuser.
Tyn Myint-U, Partial Differential Equations of Mathematical Physics,
North Holland.
Ronald B. Guenther, John W. Lee, Partial Differential Equations of
Mathematical Physics and Integral Equations,
Prentice Hall.
Gary A. Sod, Numerical Methods in Fluid Dynamics, Initial and Boundary
Value Problems, Cambridge Univ. Press.E. Venturino, notes in preparation -
F. Brauer, C. Castillo-Chavez, Mathematical Models in Population Biology
and Epidemiology, Springer.
J.D. Murray, Mathematical Biology, Springer.
J. Cronin, Mathematical Aspects of Hodgkin-Huxley neural theory,
Cambridge Univ. Press.
B. Charlesworth, Evolution in age-structured populations,
Cambridge Univ. Press.
H. Smith, P. Waltman, The theory of the Chemostat,
Cambridge Univ. Press.
E. Renshaw, Modelling Biological Populations in Space and Time,
Cambridge Univ. Press.
V. Comincioli, Problemi e Modelli Matematici nelle Scienze Applicate,
Ambrosiana.
A. Okubo, S. Levin, Diffusion and Ecological Problems: Modern
Perspectives, Springer, 2001.
Stanley J. Farlow, Partial Differential Equations for Scientists and
Engineers, Dover.
David L. Powers, Boundary value problems, Academic Press.
Jeffery M. Cooper, Introduction to Partial Differential Equations
with Matlab, Birkhaeuser.
Tyn Myint-U, Partial Differential Equations of Mathematical Physics,
North Holland.
Ronald B. Guenther, John W. Lee, Partial Differential Equations of
Mathematical Physics and Integral Equations,
Prentice Hall.
Gary A. Sod, Numerical Methods in Fluid Dynamics, Initial and Boundary
Value Problems, Cambridge Univ. Press. - Oggetto:
Orario lezioni
Giorni Ore Aula Lezioni: dal 02/03/2015 al 05/06/2015 Nota: Per l'orario delle lezioni consultare la pagina "Orario Lezioni":http://www.educmatematica.unito.it/CMSOrari/index.html
- Oggetto:
Note
BIOMATEMATICA, MFN0430 (DM 270), 6 CFU: 6 CFU, MAT/08, TAF C (Affine/integrativa), Ambito formative affini o integrative. Modalità di verifica/esame: Presentazione e discussione di un progetto redatto a squadre di 2 o 3 studenti in sala informatizzata.
Modalità di verifica/esame: Presentazione e discussione di un progetto redatto a squadre di 2 o 3 studenti in sala informatizzata.
Almeno parte del corso sara' svolto in lingua inglese
- Oggetto: